Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 SSZ1YHR064C 1617 nt5.09□□□□□ -1.59
NMD4Q12129 TIM54YJL054W 1437 nt5.09□□□□□ -1.59
NMD4Q12129 YGL036WYGL036W 2730 nt5.09□□□□□ -1.59
NMD4Q12129 UBC1YDR177W 648 nt5.09□□□□□ -1.59
NMD4Q12129 YKR041WYKR041W 753 nt5.09□□□□□ -1.59
NMD4Q12129 PRM9YAR031W 897 nt5.09□□□□□ -1.59
NMD4Q12129 ROX3YBL093C 663 nt5.09□□□□□ -1.59
NMD4Q12129 ANT1YPR128C 987 nt5.09□□□□□ -1.59
NMD4Q12129 ARN2YHL047C 1863 nt5.09□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 SIA1YOR137C 1869 nt5.09□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 GAS2YLR343W 1668 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 VPS1YKR001C 2115 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 ARP2YDL029W 1176 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 NQM1YGR043C 1002 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MND2YIR025W 1107 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 XPT1YJR133W 630 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YKL151CYKL151C 1014 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MRPL13YKR006C 795 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YLR118CYLR118C 684 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 ROT1YMR200W 771 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 LEM3YNL323W 1245 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 BRF1YGR246C 1791 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 SEO1YAL067C 1782 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 HAP1YLR256W 4509 nt5.08□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YIL086CYIL086C 309 nt5.07□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MHO1YJR008W 1017 nt5.07□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MRT4YKL009W 711 nt5.07□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YNG1YOR064C 660 nt5.07□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 FES1YBR101C 873 nt5.07□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 SRB6YBR253W 366 nt5.07□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 PHO8YDR481C 1701 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 TMN2YDR107C 2019 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 QDR1YIL120W 1692 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MED2YDL005C 1296 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YHP1YDR451C 1062 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 CAF16YFL028C 870 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 EDC1YGL222C 528 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 SYN8YAL014C 768 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 DAN1YJR150C 897 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YMR114CYMR114C 1107 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YPR015CYPR015C 744 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MPH2YDL247W 1830 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 KIP2YPL155C 2121 nt5.06□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 RPT2YDL007W 1314 nt5.05□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 GCS1YDL226C 1059 nt5.05□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MRPL7YDR237W 879 nt5.05□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 SLO1YER180C-A 258 nt5.05□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 PCT1YGR202C 1275 nt5.05□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YLR194CYLR194C 765 nt5.05□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 LDB17YDL146W 1476 nt5.05□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 BDP1YNL039W 1785 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 HST1YOL068C 1512 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 NRD1YNL251C 1728 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YFL034WYFL034W 3222 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 PRO3YER023W 861 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 PRS1YKL181W 1284 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 ADD66YKL206C 804 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 RAD17YOR368W 1206 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 FRE3YOR381W 2136 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 RRN3YKL125W 1884 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YDR444WYDR444W 2064 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 DPH2YKL191W 1605 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 SOG2YOR353C 2376 nt5.04□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 AIM10YER087W 1731 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 PAF1YBR279W 1338 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YDR249CYDR249C 1122 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 ERG26YGL001C 1050 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 RPT6YGL048C 1218 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 TIM21YGR033C 720 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 TDH3YGR192C 999 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 CBF1YJR060W 1056 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 MUP3YHL036W 1641 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 WTM2YOR229W 1404 nt5.03□□□□□ -1.6
NMD4Q12129 DBF4YDR052C 2115 nt5.02□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 YLF2YHL014C 1218 nt5.02□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 YHR127WYHR127W 732 nt5.02□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 SCO1YBR037C 888 nt5.02□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 COQ6YGR255C 1440 nt5.02□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 APL6YGR261C 2430 nt5.02□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 RPT4YOR259C 1314 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 RMD1YDL001W 1293 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 CIA2YHR122W 696 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 POM33YLL023C 840 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 REX3YLR107W 1215 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 YLR374CYLR374C 390 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 NRM1YNR009W 750 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 RER2YBR002C 861 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 YOR318CYOR318C 306 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 STE50YCL032W 1041 nt5.01□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 SSY5YJL156C 2100 nt5□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 MLC1YGL106W 450 nt5□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 YPT32YGL210W 669 nt5□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 YGR182CYGR182C 354 nt5□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 ARD1YHR013C 717 nt5□□□□□ -1.61
NMD4Q12129 YIL152WYIL152W 708 nt5□□□□□ -1.61
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