Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLFN5Q08AF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFN5Q08AF3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms