Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YMR027WYMR027W 1413 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 COBQ0105 1158 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 SKI8YGL213C 1194 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 HAP2YGL237C 798 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 THI4YGR144W 981 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 CUP1-1YHR053C 186 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 CUP1-2YHR055C 186 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 POR2YIL114C 846 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 RPS5YJR123W 678 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 QRI5YLR204W 336 nt6.27□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 YOL035CYOL035C 303 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 FDH1YOR388C 1131 nt6.27□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 snR19snR19 568 nt6.27□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 CYC8YBR112C 2901 nt6.26□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 PRP19YLL036C 1512 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YDL023CYDL023C 321 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 AIM6YDL237W 1173 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YIP5YGL161C 933 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 BTN2YGR142W 1233 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 DOT5YIL010W 648 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 RPE1YJL121C 717 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 CMC1YKL137W 336 nt6.26□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 GMC2YLR445W 567 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 LDB19YOR322C 2457 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 RAD24YER173W 1980 nt6.26□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 CTF13YMR094W 1437 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YDL027CYDL027C 1263 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 QRI7YDL104C 1224 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PAD1YDR538W 729 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 IRC7YFR055W 1023 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 NVJ1YHR195W 966 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PRE3YJL001W 648 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 SRP21YKL122C 504 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 MRPL13YKR006C 795 nt6.25□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 NBP1YLR457C 960 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 EAF7YNL136W 1278 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PDR16YNL231C 1056 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 SAS5YOR213C 747 nt6.25□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 YPL102CYPL102C 303 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YBR053CYBR053C 1077 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YPR109WYPR109W 885 nt6.25□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 MSS1YMR023C 1581 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 snR63snR63 255 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 BMH1YER177W 804 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 RPN11YFR004W 921 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YJL215CYJL215C 360 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 MBR1YKL093W 1020 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 CCP1YKR066C 1086 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 CIN4YMR138W 576 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PIN2YOR104W 849 nt6.24□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 MGE1YOR232W 687 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 BPL1YDL141W 2073 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 AIR2YDL175C 1035 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YGL230CYGL230C 444 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PSF2YJL072C 642 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YJU3YKL094W 942 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 NYV1YLR093C 762 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 VMA4YOR332W 702 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PCS60YBR222C 1632 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 VPS72YDR485C 2388 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 DXO1YDR370C 1329 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YIL055CYIL055C 1884 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PYK2YOR347C 1521 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 NSE4YDL105W 1209 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 CPR1YDR155C 489 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PFA5YDR459C 1125 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 PHB1YGR132C 864 nt6.22□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF3Q07807 YHB1YGR234W 1200 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YGR273CYGR273C 525 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 DID4YKL002W 699 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 SPC34YKR037C 888 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 SMD2YLR275W 333 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 YOR105WYOR105W 327 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 IRS4YKR019C 1848 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 RAD3YER171W 2337 nt6.21□□□□□ -1.41
PUF3Q07807 SPR3YGR059W 1539 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SKS1YPL026C 1509 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MPO1YGL010W 525 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RNA15YGL044C 891 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 LEU5YHR002W 1074 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YIL077CYIL077C 963 nt6.21□□□□□ -1.42 RIP-Chip
PUF3Q07807 TPT1YOL102C 693 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 HNT3YOR258W 654 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YNL247WYNL247W 2304 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YEL020CYEL020C 1683 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RGD1YBR260C 2001 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 PTC1YDL006W 846 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 TGL2YDR058C 981 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RNH202YDR279W 1053 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 PTI1YGR156W 1278 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 BUD32YGR262C 786 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 PRP21YJL203W 843 nt6.2□□□□□ -1.42
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