Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC63Q05C16 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC63Q05C16 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms