Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLOD1Q02809 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLOD1Q02809 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLOD1Q02809 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms