Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE1BQ01064 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms