Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERV-K104P61576 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms