Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 PFA4YOL003C 1137 nt5.48□□□□□ -1.53
VFA1P40080 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.48□□□□□ -1.53
VFA1P40080 ETT1YOR051C 1239 nt5.48□□□□□ -1.53
VFA1P40080 ETR1YBR026C 1143 nt5.48□□□□□ -1.53
VFA1P40080 ROG3YFR022W 2202 nt5.47□□□□□ -1.53
VFA1P40080 GSH2YOL049W 1476 nt5.47□□□□□ -1.53
VFA1P40080 KNH1YDL049C 807 nt5.47□□□□□ -1.53
VFA1P40080 ARD1YHR013C 717 nt5.47□□□□□ -1.53
VFA1P40080 SFT2YBL102W 648 nt5.47□□□□□ -1.53
VFA1P40080 DCI1YOR180C 816 nt5.47□□□□□ -1.53
VFA1P40080 UBA1YKL210W 3075 nt5.47□□□□□ -1.53
VFA1P40080 MGS1YNL218W 1764 nt5.47□□□□□ -1.53
VFA1P40080 PDI1YCL043C 1569 nt5.46□□□□□ -1.53
VFA1P40080 GUP2YPL189W 1830 nt5.46□□□□□ -1.53
VFA1P40080 RSC6YCR052W 1452 nt5.46□□□□□ -1.53
VFA1P40080 NMT1YLR195C 1368 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 AAD4YDL243C 990 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YGR273CYGR273C 525 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 SPO16YHR153C 597 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 RPB4YJL140W 666 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 SED5YLR026C 1023 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 MID2YLR332W 1131 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 SEC17YBL050W 879 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 CPA1YOR303W 1236 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 SAM4YPL273W 978 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 ISA2YPR067W 558 nt5.46□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YNL108CYNL108C 813 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 HRT1YOL133W 366 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 VPS28YPL065W 729 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 CAR1YPL111W 1002 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 MRL1YPR079W 1146 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 APM2YHL019C 1818 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 SOG2YOR353C 2376 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 TEA1YOR337W 2280 nt5.45□□□□□ -1.54
VFA1P40080 STE12YHR084W 2067 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 SLC1YDL052C 912 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 IWR1YDL115C 1062 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YDR249CYDR249C 1122 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 DIN7YDR263C 1293 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 SAY1YGR263C 1275 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 ARP1YHR129C 1155 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 STE13YOR219C 2796 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 MET31YPL038W 534 nt5.44□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YEL020CYEL020C 1683 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 NOB1YOR056C 1380 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 MAL11YGR289C 1851 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 PRT1YOR361C 2292 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 MHF2YDL160C-A 243 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 TRS23YDR246W 660 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 MLC1YGL106W 450 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YGR182CYGR182C 354 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YNG2YHR090C 849 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YJR056CYJR056C 711 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YLR124WYLR124W 345 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 UIP3YAR027W 708 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YPL073CYPL073C 486 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 ROT2YBR229C 2865 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YGL036WYGL036W 2730 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 STE7YDL159W 1548 nt5.43□□□□□ -1.54
VFA1P40080 GRX6YDL010W 696 nt5.42□□□□□ -1.54
VFA1P40080 FUN19YAL034C 1242 nt5.42□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YMR245WYMR245W 621 nt5.42□□□□□ -1.54
VFA1P40080 HXT7YDR342C 1713 nt5.42□□□□□ -1.54
VFA1P40080 HXT6YDR343C 1713 nt5.42□□□□□ -1.54
VFA1P40080 ADE3YGR204W 2841 nt5.42□□□□□ -1.54
VFA1P40080 TFG1YGR186W 2208 nt5.42□□□□□ -1.54
VFA1P40080 JEM1YJL073W 1938 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 MSH1YHR120W 2880 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YDR134CYDR134C 411 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 NSE3YDR288W 912 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 THI5YFL058W 1023 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 RPL28YGL103W 450 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YHR214WYHR214W 612 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YAR066WYAR066W 612 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 THI12YNL332W 1023 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 COX11YPL132W 903 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 QCR2YPR191W 1107 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 IXR1YKL032C 1794 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 CLB5YPR120C 1308 nt5.41□□□□□ -1.54
VFA1P40080 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.4□□□□□ -1.54
VFA1P40080 MHO1YJR008W 1017 nt5.4□□□□□ -1.54
VFA1P40080 RPS31YLR167W 459 nt5.4□□□□□ -1.54
VFA1P40080 RBA50YDR527W 1320 nt5.4□□□□□ -1.55
VFA1P40080 ABD1YBR236C 1311 nt5.4□□□□□ -1.55
VFA1P40080 HOS1YPR068C 1413 nt5.4□□□□□ -1.55
VFA1P40080 APE1YKL103C 1545 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 CAF16YFL028C 870 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 SCL1YGL011C 759 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 GRE3YHR104W 984 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 BLS1YLR408C 369 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 GPI2YPL076W 843 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 BBP1YPL255W 1158 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 NRG2YBR066C 663 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 ELP2YGR200C 2367 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 GRS1YBR121C 2004 nt5.39□□□□□ -1.55
VFA1P40080 CST6YIL036W 1764 nt5.39□□□□□ -1.55
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