Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH5P33151 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH5P33151 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH5P33151 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH5P33151 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH5P33151 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH5P33151 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH5P33151 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH5P33151 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH5P33151 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH5P33151 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH5P33151 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH5P33151 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH5P33151 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH5P33151 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH5P33151 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH5P33151 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH5P33151 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH5P33151 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH5P33151 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH5P33151 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH5P33151 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH5P33151 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH5P33151 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH5P33151 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH5P33151 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH5P33151 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms