Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNB1P01574 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNB1P01574 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNB1P01574 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms