Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDB2O43679 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDB2O43679 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDB2O43679 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDB2O43679 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB2O43679 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB2O43679 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB2O43679 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB2O43679 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB2O43679 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB2O43679 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB2O43679 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDB2O43679 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB2O43679 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB2O43679 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB2O43679 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB2O43679 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB2O43679 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB2O43679 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDB2O43679 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDB2O43679 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDB2O43679 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB2O43679 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB2O43679 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms