Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAD1O00515 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAD1O00515 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAD1O00515 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAD1O00515 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAD1O00515 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAD1O00515 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAD1O00515 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAD1O00515 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAD1O00515 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAD1O00515 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAD1O00515 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAD1O00515 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAD1O00515 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAD1O00515 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAD1O00515 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAD1O00515 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAD1O00515 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAD1O00515 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAD1O00515 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAD1O00515 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAD1O00515 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAD1O00515 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAD1O00515 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAD1O00515 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAD1O00515 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LAD1O00515 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAD1O00515 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAD1O00515 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAD1O00515 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAD1O00515 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAD1O00515 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAD1O00515 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAD1O00515 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAD1O00515 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAD1O00515 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAD1O00515 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAD1O00515 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAD1O00515 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAD1O00515 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAD1O00515 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAD1O00515 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAD1O00515 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms