Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGTLC3B5MD39 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGTLC3B5MD39 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms