Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM25AB3EWG3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM25AB3EWG3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms