Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C9orf92A6NGG3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C9orf92A6NGG3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms