Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
U3KQE9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
U3KQE9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
U3KQE9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
U3KQE9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
U3KQE9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
U3KQE9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U3KQE9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U3KQE9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U3KQE9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U3KQE9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
U3KQE9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U3KQE9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
U3KQE9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
U3KQE9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
U3KQE9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
U3KQE9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
U3KQE9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
U3KQE9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U3KQE9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U3KQE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U3KQE9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U3KQE9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
U3KQE9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
U3KQE9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
U3KQE9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms