Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COG6Q9Y2V7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COG6Q9Y2V7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COG6Q9Y2V7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.6 ms