Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL9Q9P2J3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms