Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDAP2Q9NXN4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDAP2Q9NXN4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms