Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG6Q9BXT2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNG6Q9BXT2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG6Q9BXT2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms