Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF12Q96QT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF12Q96QT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms