Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERAC1Q96JX3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERAC1Q96JX3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERAC1Q96JX3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.9 ms