Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC34Q96HJ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC34Q96HJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms