Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDLIM5Q96HC4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDLIM5Q96HC4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDLIM5Q96HC4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms