Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHE23Q8NDY6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE23Q8NDY6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms