Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MUC6Q6W4X9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MUC6Q6W4X9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms