Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SQLEQ14534 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SQLEQ14534 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SQLEQ14534 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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