Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3FQ13275 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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