Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 PMT2YAL023C 2280 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 FHL1YPR104C 2811 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 URA7YBL039C 1740 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 SAS4YDR181C 1446 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 IMG2YCR071C 441 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 YLR036CYLR036C 612 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 PRE7YBL041W 726 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 NPT1YOR209C 1290 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 POS5YPL188W 1245 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 NSI1YDR026C 1713 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 SSZ1YHR064C 1617 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 WTM1YOR230W 1314 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 GSY2YLR258W 2118 nt5.21□□□□□ -1.57
PUF2Q12221 MMR1YLR190W 1476 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 MED2YDL005C 1296 nt5.21□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 VCX1YDL128W 1236 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 YDR053WYDR053W 396 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 NAG1YGR031C-A 492 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 RPC19YNL113W 429 nt5.21□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPO77YLR341W 1434 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 MSH1YHR120W 2880 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 JEM1YJL073W 1938 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 RAM1YDL090C 1296 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 NMD4YLR363C 657 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 YOL035CYOL035C 303 nt5.2□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 VPS70YJR126C 2436 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 ADE4YMR300C 1533 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 snR57snR57 88 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 MAF1YDR005C 1188 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 ERD1YDR414C 1089 nt5.19□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 VAM7YGL212W 951 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 CLD1YGR110W 1338 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 OXP1YKL215C 3861 nt5.19□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 RRP45YDR280W 918 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 YJR056CYJR056C 711 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 KTI12YKL110C 942 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 OMA1YKR087C 1038 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 SPC97YHR172W 2472 nt5.18□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 RIM101YHL027W 1878 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 PRR1YKL116C 1557 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 AAD6YFL056C 639 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 MTW1YAL034W-A 870 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 YKR041WYKR041W 753 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 MRL1YPR079W 1146 nt5.17□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 HER2YMR293C 1395 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 RTN1YDR233C 888 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 FAU1YER183C 636 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 YGR066CYGR066C 879 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 RHO3YIL118W 696 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 YKL223WYKL223W 333 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 VTA1YLR181C 993 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 TOM5YPR133W-A 153 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 MKK2YPL140C 1521 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 DAK1YML070W 1755 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 ATG32YIL146C 1590 nt5.16□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 SRV2YNL138W 1581 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 VHS1YDR247W 1386 nt5.16□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 THP1YOL072W 1368 nt5.16□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 PDC1YLR044C 1692 nt5.15□□□□□ -1.58
PUF2Q12221 CTS1YLR286C 1689 nt5.15□□□□□ -1.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 NIT2YJL126W 924 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 PEX22YAL055W 543 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 AME1YBR211C 975 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 NOT3YIL038C 2511 nt5.15□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 IPK1YDR315C 846 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 YHR095WYHR095W 495 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 YPL014WYPL014W 1146 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 CAM1YPL048W 1248 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 TUB2YFL037W 1374 nt5.14□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 YIL067CYIL067C 2037 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 RPB4YJL140W 666 nt5.13□□□□□ -1.59 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPL3YOR063W 1164 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 DBP9YLR276C 1785 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 MPC54YOR177C 1395 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 MAL11YGR289C 1851 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 CTS2YDR371W 1536 nt5.13□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 PCL9YDL179W 915 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 PPA2YMR267W 933 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 RRP40YOL142W 723 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 ISU2YOR226C 471 nt5.12□□□□□ -1.59 RIP-Chip
PUF2Q12221 ENV9YOR246C 993 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 snR32snR32 188 nt5.12□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 YEL077CYEL077C 3834 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 HST4YDR191W 1113 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 YEL028WYEL028W 462 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 XPT1YJR133W 630 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 UBC12YLR306W 567 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 SCW10YMR305C 1170 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 NCE103YNL036W 666 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 VID30YGL227W 2877 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 UBA1YKL210W 3075 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 VAN1YML115C 1608 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 UBX2YML013W 1755 nt5.11□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 AI3Q0060 1248 nt5.1□□□□□ -1.59
PUF2Q12221 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.1□□□□□ -1.59
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