Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 PML1YLR016C 615 nt5.34□□□□□ -1.55
SPE3Q12074 PDR16YNL231C 1056 nt5.34□□□□□ -1.55
SPE3Q12074 NRD1YNL251C 1728 nt5.34□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 SIR2YDL042C 1689 nt5.34□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 YIL067CYIL067C 2037 nt5.33□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 WTM1YOR230W 1314 nt5.33□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 YPT32YGL210W 669 nt5.33□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 YIR043CYIR043C 693 nt5.33□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 OCA1YNL099C 717 nt5.33□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 RIM15YFL033C 5313 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 MSH1YHR120W 2880 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 LAS21YJL062W 2493 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 VPS29YHR012W 849 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 RSA3YLR221C 663 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 RPA49YNL248C 1248 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 SCO1YBR037C 888 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 STE50YCL032W 1041 nt5.32□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 LAP2YNL045W 2016 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 LPL1YOR059C 1353 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 PHO86YJL117W 936 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 YOR292CYOR292C 930 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 FRE3YOR381W 2136 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 TIP41YPR040W 1071 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 SIP5YMR140W 1470 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 YTA12YMR089C 2478 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 MEC3YLR288C 1425 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 IML2YJL082W 2196 nt5.31□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 ECM3YOR092W 1842 nt5.3□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 APJ1YNL077W 1587 nt5.3□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 RPT4YOR259C 1314 nt5.3□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 PHA2YNL316C 1005 nt5.3□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 SUE1YPR151C 621 nt5.3□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 DCC1YCL016C 1143 nt5.3□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 OCA5YHL029C 2040 nt5.3□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 GTR1YML121W 933 nt5.29□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 HXT5YHR096C 1779 nt5.29□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 RPN12YFR052W 825 nt5.28□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 COX11YPL132W 903 nt5.28□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 ATG20YDL113C 1923 nt5.28□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 AVT3YKL146W 2079 nt5.28□□□□□ -1.56
SPE3Q12074 MTW1YAL034W-A 870 nt5.27□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 RPC19YNL113W 429 nt5.27□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 SPS18YNL204C 903 nt5.27□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 YOL035CYOL035C 303 nt5.27□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 YOR024WYOR024W 324 nt5.27□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 VPS1YKR001C 2115 nt5.27□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 GAL10YBR019C 2100 nt5.27□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 SIS2YKR072C 1689 nt5.27□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 DIT1YDR403W 1611 nt5.26□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 SDA1YGR245C 2304 nt5.26□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 UBP7YIL156W 3216 nt5.26□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 SSY5YJL156C 2100 nt5.26□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 ERD1YDR414C 1089 nt5.26□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 ECM1YAL059W 639 nt5.26□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 RCL1YOL010W 1104 nt5.26□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 PEX22YAL055W 543 nt5.25□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 ALG5YPL227C 1005 nt5.25□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 ARH1YDR376W 1482 nt5.25□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 RAD53YPL153C 2466 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 YDL121CYDL121C 450 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 MDY2YOL111C 639 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 CAM1YPL048W 1248 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 VHS1YDR247W 1386 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 YIL092WYIL092W 1902 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 NOP8YOL144W 1455 nt5.24□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 RAT1YOR048C 3021 nt5.23□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 RML2YEL050C 1182 nt5.23□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 KCH1YJR054W 1494 nt5.23□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 YNL095CYNL095C 1929 nt5.23□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 GPI18YBR004C 1302 nt5.23□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 CBP1YJL209W 1965 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 MNN10YDR245W 1182 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 NAG1YGR031C-A 492 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 CAB4YGR277C 918 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 SPC42YKL042W 1092 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 FEX1YOR390W 1128 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 FEX2YPL279C 1128 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 NHP6AYPR052C 282 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 DRN1YGR093W 1524 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 MET3YJR010W 1536 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 ARN2YHL047C 1863 nt5.22□□□□□ -1.57
SPE3Q12074 ARP10YDR106W 855 nt5.21□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 PUS6YGR169C 1215 nt5.21□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 CWC25YNL245C 540 nt5.21□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 RPL21BYPL079W 483 nt5.21□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 GRS1YBR121C 2004 nt5.21□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 PSY4YBL046W 1326 nt5.21□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 YDR132CYDR132C 1488 nt5.2□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 GIP2YER054C 1647 nt5.2□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 EXO1YOR033C 2109 nt5.2□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 FMP48YGR052W 1110 nt5.2□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 YJL107CYJL107C 1164 nt5.2□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 ARO7YPR060C 771 nt5.2□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 PUS1YPL212C 1635 nt5.19□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 YPL245WYPL245W 1365 nt5.19□□□□□ -1.58
SPE3Q12074 WHI4YDL224C 1950 nt5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms