Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPARAQ07869 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPARAQ07869 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPARAQ07869 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPARAQ07869 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms