Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE1BQ01064 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE1BQ01064 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE1BQ01064 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms