Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
NESP48681 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
NESP48681 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
NESP48681 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NESP48681 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NESP48681 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
NESP48681 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NESP48681 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NESP48681 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
NESP48681 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NESP48681 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NESP48681 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NESP48681 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
NESP48681 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NESP48681 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NESP48681 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
NESP48681 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NESP48681 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
NESP48681 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NESP48681 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NESP48681 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NESP48681 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NESP48681 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NESP48681 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NESP48681 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NESP48681 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NESP48681 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NESP48681 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NESP48681 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NESP48681 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NESP48681 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NESP48681 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NESP48681 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NESP48681 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
NESP48681 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.49■■■■■ 4.07
NESP48681 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NESP48681 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
NESP48681 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NESP48681 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NESP48681 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
NESP48681 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
NESP48681 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NESP48681 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NESP48681 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NESP48681 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NESP48681 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NESP48681 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NESP48681 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
NESP48681 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NESP48681 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NESP48681 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NESP48681 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NESP48681 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NESP48681 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NESP48681 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NESP48681 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NESP48681 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NESP48681 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
NESP48681 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
NESP48681 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NESP48681 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NESP48681 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NESP48681 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NESP48681 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NESP48681 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NESP48681 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NESP48681 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NESP48681 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
NESP48681 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
NESP48681 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NESP48681 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NESP48681 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NESP48681 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NESP48681 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NESP48681 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NESP48681 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NESP48681 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NESP48681 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NESP48681 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NESP48681 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
NESP48681 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NESP48681 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NESP48681 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
NESP48681 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
NESP48681 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
NESP48681 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
NESP48681 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
NESP48681 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NESP48681 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NESP48681 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NESP48681 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
NESP48681 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms