Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCIP41743 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCIP41743 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms