Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN7P35236 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN7P35236 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms