Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXA10P31260 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HOXA10P31260 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXA10P31260 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXA10P31260 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms