Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms