Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT87PA6NCN2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT87PA6NCN2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms