Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMCO3A2RU48 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMCO3A2RU48 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms