Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPK6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPK6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A096LPK6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A096LPK6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A096LPK6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A096LPK6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A096LPK6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms