Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPSEQ9Y251 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
HPSEQ9Y251 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPSEQ9Y251 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms