Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
REXO4Q9GZR2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REXO4Q9GZR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REXO4Q9GZR2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms