Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SGIP1Q9BQI5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SGIP1Q9BQI5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SGIP1Q9BQI5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGIP1Q9BQI5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms