Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLUAP1Q96AJ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLUAP1Q96AJ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLUAP1Q96AJ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLUAP1Q96AJ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLUAP1Q96AJ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLUAP1Q96AJ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLUAP1Q96AJ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLUAP1Q96AJ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLUAP1Q96AJ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms