Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX1Q92499 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms