Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00301Q8NCQ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00301Q8NCQ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00301Q8NCQ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms