Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms