Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC01545Q5VT33 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms