Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROCCQ5TZA2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROCCQ5TZA2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROCCQ5TZA2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms