Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN3Q16667 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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